В Katana Zero нет очков здоровья и любой удар по персонажу приведёт к мгновенной смерти, подобно игре Hotline Miami. Игрок проходит уровни, пытаясь убить всех противников, используя клинок или ловушки. Персонаж может отбивать пули противника ударом своего клинка, а также уклоняться от атак с помощью перекатов. Также основной особенностью игры является способность ненадолго замедлять время, что часто помогает избежать смерти. В игре присутствует вариативная система диалогов, в которой персонаж может перебивать и оскорблять собеседника